北京大学口腔医学院始建于1941年，是集北京大学口腔医学院、口腔医院和口腔医学研究所为一体的医疗机构，长期以来承担着向社会提供口腔医疗保健服务和口腔教学、医学研究的重任。拥有诸多国内外著名的口腔医学专家，为我国口腔界培养了一批批高素质、高层次专业人才，成为我国重要的口腔医学研究基地之一，是我国口腔医学对外交流的重要窗口。
作为卫生部部管的三级甲等口腔专科医院，是目前国际上口腔专科医疗服务规模最大的医疗机构。现有临床科室15个，医技科室8个，下属分支医疗机构5个，牙科综合治疗台510台，开放病床157张，职工2000余人。2012年门急诊量超过117万人次，日均门急诊近4000人次，年收治住院病人5000余人。还承担着党和国家领导人及其他重要人员的口腔医疗保健工作。在长期学科建设和临床实践的基础上，已逐步凝练、形成了独具特色的口腔医学临床学科群。目前有四项口腔类别“国家临床重点专科”建设项目：牙体牙髓病科、牙周病科、口腔颌面外科、口腔修复科。自2009年起，连续三年被评为“中国最佳医院及最佳专科排行榜”口腔专科第一名。
作为我国高层次口腔医学专业人才的培养基地，现有专业教研组（室）21个，博士生导师44人，硕士生导师49人，拥有国家“千人计划”特聘专家、“长江学者”讲座教授、杰出青年基金获得者等著名专家，聘请境外数十名知名学者任院级客座教授。是首批一级学科硕士、博士点授权单位，同时也是目前全国唯一由教育部批准招收口腔医学八年制本博连读生的口腔医学院校，目前在校生总数700余人。在15部口腔医学全国统编教材中7部教材的主编由我院教授担任。中国第一位医学博士（1984年）、第一批口腔临床技能型博士（1988年）、第一位口腔医学双博士（2012年）均由我院培养。几十年来，北京大学口腔医学院培养出一代代优秀的学子，推动了中国口腔医学事业的发展，也涌现出一批在国际口腔医学领域颇具成果的著名学者和专家。
北京大学口腔医学研究所成立于1978年，目前设有中心实验室1个、临床和基础研究实验室13个、以口腔常见疾病防治为主导的跨学科研究中心11个、实验动物室1个和1所口腔医学专业图书馆。医学领域第一家“口腔数字化医疗技术和材料国家工程实验室”、全国唯一“国家口腔医学国际科技合作基地”、“卫生部口腔医学计算机应用工程技术研究中心”和作为国内十大国家级医疗器械质量监督检验中心之一的“口腔医疗器械检验中心”均设在我院。
作为国内口腔医学院校的领军单位之一，北京大学口腔医学院一直是中华口腔医学会的支撑单位和会长单位，也一直是《中华口腔医学杂志》的总编单位。在中华口腔医学会的24个专业委员会中，8个专委会的主任委员和3个专委会的候任主任委员由我院教授担任。受卫生部、中国医院协会等部门委托，制定口腔领域多项标准、规范《口腔专科医院评审标准》、口腔专业临床路径标准等。
医院多年来广泛开展口腔健康教育、社区健康促进和农村教学基地建设等工作，是中国牙病防治基金会的支撑单位。在1981年即被世界卫生组织批准为“WHO预防牙医学科科研与培训合作中心”。先后主持完成了三次全国口腔健康流行病学调查，组织领导了20多年“全国爱牙日”活动，并参与举办口腔健康咨询、义诊、讲座等公益活动。作为牵头单位，联合全国多家口腔专业单位获批立项2011年度卫生公益性行业科研专项经费项目“城乡居民牙病综合防治模式推广应用研究”。2012年又成为卫生部“防治结合型医院”试点单位，牵头全国口腔医学的防治结合工作。协助政府制定了我国口腔卫生保健的目标规划，进行长期的口腔健康教育和观念启蒙，对规范和发展我国口腔预防医学和牙病防治事业起到了重要作用。
作为国内口腔医学对外交流的重要窗口，先后与境外多所口腔医学院（校）和相关学术机构签署了学术合作谅解备忘录。每年接待大量外宾，多次举办大型国际和地区性学术会议，并聘请多位世界著名教授、学者为我院名誉教授或客座教授，已成为国内外学术交流的重要平台，其国际影响力也显著增强。
70年来，北京大学口腔医学院不但赢得了国内外较高的学术地位，培养了大批口腔医学人才，而且还形成了极具特色的医院文化，“厚德尚学、精医济世”的院训作为北京大学口腔医学院的核心文化理念，激励着北大口腔人为了早日实现“建设世界一流口腔医学院”的目标而不断开拓进取、追求卓越。